SPMでSPECT画像やPET画像を標準化するとき、Normalise (Est & Write)から行います。しかし、この時、Source ImageとImages to Writeにいちいち画像ファイルを指定せねばならず、苦痛を伴います。
私の友人の岩手医大の山下典生先生が、この問題を解決するスクリプトを書いて下さいました。
使い方はいたって簡単です。
- fy_normalise.mをダウンロード（右クリックで名前をつけてリンク先を保存）し、SPMのフォルダの中に保存します。
- Matlabから以下のようにタイプします。
- すると画像を選択するダイアログが出現しますので、標準化したいファイルを選択します。
- 次に、ディレクトリを聞かれますので、設定ファイルを保存したいディレクトリを指定します。
- そうすると、保存先にspm_normalise_20140117_1621112.matのようなファイルが保存されます。
- 次に、SPMのBatchを起動し、ファイルを開くから先ほど保存したmatファイルをしてします。
- そうすると、Subjectが指定された状態になります。
- パラメータを確認し、大丈夫であることを確認したら、実行すれば解剖学的標準化がはじまります。
fy_normalise
非常に便利なので、関心のある方はどうぞお使いください。なお、fy_normalise(”,1)とすると、一度に標準化を走らせることもできますが、設定ミスで後悔しないように、設定を確認してから走らせることをお勧めします。
山下先生、ありがとうございました！
いつもお世話になっております。
根本先生、山下先生ありがとうございました。
ぜひ使用させていただきます。
高橋先生
ご丁寧にコメントをありがとうございます。
便利なスクリプトですので、どうぞご活用ください。
何かご質問などがありましたらまたご連絡いただけたらと思います。
今後ともよろしくお願いします。