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When using FreeSurfer and FSL 6.0.6 or later, a certain issue may arise:

• Python3 becomes the Python3 provided by FSL.
• dcm2niix becomes the dcm2niix provided by FSL.

First, I will explain how to confirm if you are affected by this issue and then provide the solutions along with the reasons.

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FreeSurfer と FSL 6.0.6以降を使っていると、ある事象が起きます。

• Python3がFSLが提供するPython3になります。
• dcm2niixがFSLが提供するdcm2niixになります。

これの影響を受けているかの確認法および対処法を最初に解説した後、その理由を述べます。

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