FSLViewを使うと、2つの画像を簡単に重ねあわせて表示できるわけですが、その際に様々なオプションを組み合わせることで画像をわかりやすく見せることができます。
主に3つ覚えておけば、結構いけるなと思いましたので、その3つを紹介します。
その3つとは、
- -l (Lookup table)
- -b (Brightness)
- -t (Transparency)
です。
FSLViewを使うと、2つの画像を簡単に重ねあわせて表示できるわけですが、その際に様々なオプションを組み合わせることで画像をわかりやすく見せることができます。
主に3つ覚えておけば、結構いけるなと思いましたので、その3つを紹介します。
その3つとは、
です。
FSLViewで画像を表示すると、思ったような向きで表示されないときがあります。
下に例を示します。
ここでは、上にある水平断、冠状断が角度が変になってしまっています。
しかし、よくみると、FSLViewは画像の前後をきちんと認識しています。
画像のまわりにあるアルファベットはそれぞれ
A: anterior
P: posterior
L: left
R: right
I: inferior
S: superior
を意味しますが、正しくなっています。
それでは、「正しく」表示するにはどうしたらよいでしょうか。
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I found that now FSLView is available in Ubuntu 12.04
Below is the screenshot I installed in Lin4Neuro.
Now I do not have any hesitation moving from Ubuntu 10.04 to Ubuntu 12.04 (Actually Xubuntu 12.04)
So from now on I will stop developing Lin4Neuro based on Ubuntu 10.04. I keep working on getting Lin4Neuro based on Xubuntu 12.04 better and better.