私がもっているデータのひとつに縦断DTIデータがあり、東京都健康長寿医療センターの下地先生が包括脳/ABiSチュートリアルで教えてくださっているTBSSを用いて解析を行っています。(下地先生は非常にわかりやすい講義をしてくださることで人気の先生です。)
GLMでDesign matrixを作成する時にひとつ困ったことに遭遇しました。
FSLのGLM Wizardでは、対応のあるt検定のDesign matrixを簡単に作成することができます。
私がもっているデータのひとつに縦断DTIデータがあり、東京都健康長寿医療センターの下地先生が包括脳/ABiSチュートリアルで教えてくださっているTBSSを用いて解析を行っています。(下地先生は非常にわかりやすい講義をしてくださることで人気の先生です。)
GLMでDesign matrixを作成する時にひとつ困ったことに遭遇しました。
FSLのGLM Wizardでは、対応のあるt検定のDesign matrixを簡単に作成することができます。
SPM12で、ひとつバグがあることがわかっています。
モデル作成の時に、maskにexplicit maskを指定すると、estimateができずに失敗するというものです。
以下のようなエラーが出ます。
Running ‘Model estimation’ SPM12: spm_spm (v6842) 11:34:04 – 25/11/2016 ======================================================================== SPM12: spm_est_non_sphericity (v6827) 11:34:05 – 25/11/2016 ======================================================================== Failed ‘Model estimation’ 存在しないフィールド ‘xVol’ を参照しています。 In file “/Users/psymacpro3/Documents/MATLAB/spm12/spm_est_non_sphericity.m” (v6827), function “spm_est_non_sphericity” at line 105. In file “/Users/psymacpro3/Documents/MATLAB/spm12/spm_spm.m” (v6842), function “spm_spm” at line 431. In file “/Users/psymacpro3/Documents/MATLAB/spm12/config/spm_run_fmri_est.m” (v5809), function “spm_run_fmri_est” at line 33. The following modules did not run: Failed: Model estimation
これは、バグであることが知られており、解決方法として、spm_est_non_sphericity.mを差し替えることが推奨されています。
下記リンクのものをダウンロードし、SPM12のフォルダに上書きしてください。
これで問題なくなります。
バグフィクスされたspm_est_non_sphericity.mをダウンロード(右クリック→名前をつけて保存で保存してください)
リソースはこちら:
https://www.jiscmail.ac.uk/cgi-bin/webadmin?A2=spm;2c0ae193.1611